Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3aP23116 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3aP23116 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3aP23116 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3aP23116 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3aP23116 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3aP23116 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3aP23116 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3aP23116 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3aP23116 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3aP23116 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3aP23116 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3aP23116 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3aP23116 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3aP23116 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3aP23116 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Eif3aP23116 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3aP23116 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3aP23116 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3aP23116 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3aP23116 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3aP23116 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3aP23116 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3aP23116 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3aP23116 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms