Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clk1P22518 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clk1P22518 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clk1P22518 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clk1P22518 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clk1P22518 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Clk1P22518 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clk1P22518 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clk1P22518 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms