Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou5f1P20263 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou5f1P20263 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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