Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P20040 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P20040 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P20040 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P20040 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P20040 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P20040 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P20040 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P20040 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P20040 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P20040 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P20040 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P20040 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P20040 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P20040 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P20040 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P20040 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P20040 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P20040 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P20040 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P20040 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P20040 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P20040 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P20040 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P20040 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P20040 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P20040 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P20040 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P20040 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P20040 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P20040 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P20040 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P20040 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P20040 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P20040 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P20040 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P20040 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P20040 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P20040 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P20040 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P20040 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P20040 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P20040 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P20040 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P20040 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P20040 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P20040 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P20040 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P20040 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P20040 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P20040 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P20040 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P20040 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P20040 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P20040 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P20040 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P20040 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P20040 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P20040 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P20040 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P20040 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P20040 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P20040 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P20040 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P20040 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P20040 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P20040 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P20040 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P20040 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P20040 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P20040 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P20040 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P20040 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P20040 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P20040 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P20040 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P20040 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms