Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Esr1P19785 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Esr1P19785 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Esr1P19785 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Esr1P19785 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Esr1P19785 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Esr1P19785 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Esr1P19785 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Esr1P19785 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Esr1P19785 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Esr1P19785 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Esr1P19785 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Esr1P19785 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Esr1P19785 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Esr1P19785 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Esr1P19785 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Esr1P19785 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Esr1P19785 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Esr1P19785 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Esr1P19785 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms