Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefhP19246 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefhP19246 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefhP19246 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NefhP19246 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NefhP19246 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefhP19246 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefhP19246 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NefhP19246 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NefhP19246 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefhP19246 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefhP19246 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NefhP19246 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefhP19246 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefhP19246 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefhP19246 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefhP19246 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefhP19246 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefhP19246 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NefhP19246 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NefhP19246 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NefhP19246 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NefhP19246 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NefhP19246 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NefhP19246 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NefhP19246 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NefhP19246 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NefhP19246 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NefhP19246 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NefhP19246 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefhP19246 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefhP19246 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefhP19246 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefhP19246 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefhP19246 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefhP19246 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefhP19246 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefhP19246 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefhP19246 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefhP19246 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefhP19246 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefhP19246 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefhP19246 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefhP19246 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefhP19246 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefhP19246 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefhP19246 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefhP19246 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NefhP19246 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefhP19246 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefhP19246 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefhP19246 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NefhP19246 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefhP19246 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefhP19246 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefhP19246 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefhP19246 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefhP19246 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefhP19246 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefhP19246 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefhP19246 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefhP19246 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefhP19246 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefhP19246 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefhP19246 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefhP19246 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefhP19246 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefhP19246 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefhP19246 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefhP19246 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefhP19246 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefhP19246 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefhP19246 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefhP19246 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefhP19246 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefhP19246 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefhP19246 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefhP19246 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefhP19246 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefhP19246 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefhP19246 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefhP19246 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefhP19246 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefhP19246 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NefhP19246 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefhP19246 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefhP19246 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefhP19246 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefhP19246 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefhP19246 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefhP19246 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefhP19246 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefhP19246 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NefhP19246 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefhP19246 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefhP19246 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefhP19246 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefhP19246 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NefhP19246 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NefhP19246 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms