Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcnaP17918 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcnaP17918 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PcnaP17918 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnaP17918 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnaP17918 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnaP17918 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnaP17918 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnaP17918 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcnaP17918 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PcnaP17918 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms