Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkceP16054 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkceP16054 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkceP16054 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkceP16054 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PrkceP16054 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PrkceP16054 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkceP16054 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkceP16054 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkceP16054 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkceP16054 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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