Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rag1P15919 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rag1P15919 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rag1P15919 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rag1P15919 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rag1P15919 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rag1P15919 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rag1P15919 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rag1P15919 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rag1P15919 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rag1P15919 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms