Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrphP15331 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrphP15331 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrphP15331 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PrphP15331 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrphP15331 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrphP15331 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrphP15331 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrphP15331 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrphP15331 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrphP15331 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrphP15331 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrphP15331 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrphP15331 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrphP15331 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrphP15331 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrphP15331 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrphP15331 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PrphP15331 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrphP15331 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrphP15331 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrphP15331 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrphP15331 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PrphP15331 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrphP15331 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrphP15331 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrphP15331 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrphP15331 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrphP15331 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrphP15331 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrphP15331 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrphP15331 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrphP15331 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrphP15331 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrphP15331 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrphP15331 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrphP15331 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrphP15331 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrphP15331 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrphP15331 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrphP15331 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrphP15331 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrphP15331 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrphP15331 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrphP15331 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrphP15331 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrphP15331 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrphP15331 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrphP15331 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PrphP15331 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrphP15331 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrphP15331 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrphP15331 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrphP15331 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrphP15331 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrphP15331 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrphP15331 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrphP15331 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PrphP15331 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrphP15331 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrphP15331 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrphP15331 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrphP15331 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PrphP15331 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PrphP15331 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrphP15331 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrphP15331 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrphP15331 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrphP15331 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrphP15331 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrphP15331 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrphP15331 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrphP15331 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrphP15331 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrphP15331 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrphP15331 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrphP15331 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrphP15331 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrphP15331 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrphP15331 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrphP15331 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrphP15331 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrphP15331 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrphP15331 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrphP15331 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PrphP15331 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrphP15331 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrphP15331 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrphP15331 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrphP15331 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrphP15331 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrphP15331 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrphP15331 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrphP15331 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrphP15331 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrphP15331 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrphP15331 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrphP15331 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrphP15331 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrphP15331 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms