Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmnb1P14733 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmnb1P14733 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms