Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni2P13412 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnni2P13412 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms