Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms