Protein–RNA interactions for Protein: P13011

Scd2, Acyl-CoA desaturase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd2P13011 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scd2P13011 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd2P13011 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd2P13011 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd2P13011 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd2P13011 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms