Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtcP11725 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtcP11725 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtcP11725 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtcP11725 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtcP11725 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtcP11725 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
OtcP11725 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtcP11725 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtcP11725 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtcP11725 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtcP11725 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OtcP11725 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtcP11725 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtcP11725 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
OtcP11725 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtcP11725 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtcP11725 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtcP11725 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtcP11725 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtcP11725 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtcP11725 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
OtcP11725 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtcP11725 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtcP11725 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtcP11725 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OtcP11725 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtcP11725 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtcP11725 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtcP11725 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtcP11725 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtcP11725 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtcP11725 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtcP11725 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtcP11725 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtcP11725 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtcP11725 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtcP11725 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtcP11725 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
OtcP11725 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
OtcP11725 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
OtcP11725 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtcP11725 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtcP11725 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtcP11725 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtcP11725 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtcP11725 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtcP11725 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtcP11725 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtcP11725 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtcP11725 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtcP11725 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtcP11725 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtcP11725 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
OtcP11725 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtcP11725 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtcP11725 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtcP11725 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtcP11725 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtcP11725 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtcP11725 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
OtcP11725 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtcP11725 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtcP11725 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtcP11725 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtcP11725 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtcP11725 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtcP11725 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtcP11725 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OtcP11725 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtcP11725 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtcP11725 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtcP11725 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtcP11725 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtcP11725 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtcP11725 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OtcP11725 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtcP11725 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtcP11725 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtcP11725 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtcP11725 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtcP11725 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms