Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DmdP11531 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DmdP11531 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DmdP11531 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DmdP11531 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DmdP11531 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DmdP11531 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DmdP11531 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DmdP11531 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DmdP11531 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DmdP11531 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DmdP11531 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DmdP11531 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DmdP11531 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DmdP11531 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DmdP11531 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DmdP11531 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DmdP11531 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DmdP11531 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DmdP11531 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DmdP11531 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DmdP11531 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DmdP11531 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DmdP11531 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DmdP11531 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DmdP11531 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DmdP11531 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DmdP11531 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DmdP11531 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DmdP11531 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DmdP11531 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DmdP11531 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DmdP11531 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DmdP11531 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DmdP11531 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DmdP11531 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DmdP11531 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DmdP11531 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DmdP11531 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DmdP11531 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DmdP11531 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DmdP11531 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DmdP11531 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DmdP11531 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DmdP11531 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DmdP11531 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DmdP11531 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DmdP11531 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DmdP11531 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DmdP11531 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DmdP11531 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DmdP11531 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DmdP11531 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DmdP11531 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DmdP11531 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DmdP11531 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DmdP11531 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DmdP11531 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DmdP11531 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DmdP11531 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DmdP11531 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DmdP11531 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DmdP11531 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DmdP11531 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DmdP11531 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DmdP11531 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DmdP11531 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DmdP11531 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DmdP11531 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DmdP11531 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DmdP11531 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DmdP11531 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DmdP11531 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DmdP11531 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DmdP11531 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DmdP11531 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DmdP11531 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DmdP11531 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DmdP11531 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DmdP11531 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DmdP11531 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DmdP11531 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DmdP11531 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DmdP11531 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DmdP11531 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DmdP11531 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DmdP11531 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DmdP11531 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DmdP11531 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DmdP11531 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DmdP11531 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DmdP11531 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DmdP11531 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DmdP11531 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DmdP11531 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DmdP11531 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DmdP11531 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DmdP11531 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DmdP11531 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DmdP11531 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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