Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FlgP11088 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FlgP11088 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FlgP11088 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FlgP11088 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FlgP11088 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FlgP11088 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FlgP11088 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FlgP11088 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FlgP11088 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FlgP11088 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FlgP11088 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FlgP11088 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FlgP11088 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FlgP11088 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FlgP11088 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FlgP11088 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FlgP11088 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FlgP11088 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FlgP11088 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FlgP11088 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FlgP11088 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FlgP11088 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FlgP11088 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FlgP11088 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FlgP11088 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FlgP11088 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FlgP11088 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FlgP11088 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FlgP11088 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FlgP11088 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FlgP11088 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FlgP11088 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FlgP11088 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FlgP11088 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FlgP11088 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FlgP11088 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FlgP11088 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FlgP11088 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FlgP11088 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FlgP11088 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FlgP11088 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FlgP11088 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FlgP11088 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FlgP11088 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FlgP11088 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FlgP11088 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FlgP11088 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FlgP11088 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FlgP11088 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FlgP11088 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FlgP11088 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FlgP11088 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FlgP11088 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FlgP11088 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FlgP11088 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FlgP11088 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FlgP11088 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FlgP11088 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FlgP11088 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FlgP11088 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FlgP11088 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FlgP11088 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FlgP11088 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FlgP11088 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FlgP11088 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FlgP11088 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FlgP11088 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FlgP11088 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FlgP11088 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FlgP11088 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FlgP11088 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FlgP11088 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FlgP11088 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FlgP11088 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FlgP11088 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FlgP11088 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FlgP11088 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FlgP11088 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FlgP11088 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FlgP11088 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FlgP11088 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FlgP11088 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FlgP11088 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FlgP11088 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FlgP11088 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FlgP11088 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FlgP11088 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FlgP11088 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FlgP11088 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FlgP11088 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FlgP11088 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FlgP11088 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FlgP11088 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FlgP11088 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FlgP11088 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FlgP11088 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FlgP11088 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FlgP11088 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FlgP11088 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms