Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P10404 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P10404 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P10404 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P10404 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P10404 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P10404 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P10404 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P10404 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P10404 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P10404 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P10404 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P10404 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P10404 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P10404 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P10404 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P10404 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P10404 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P10404 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P10404 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P10404 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P10404 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P10404 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P10404 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P10404 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P10404 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P10404 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P10404 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P10404 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P10404 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P10404 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P10404 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P10404 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P10404 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P10404 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P10404 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P10404 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P10404 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P10404 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P10404 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P10404 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P10404 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P10404 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P10404 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P10404 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P10404 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P10404 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P10404 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P10404 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P10404 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P10404 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P10404 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P10404 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P10404 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P10404 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P10404 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P10404 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P10404 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P10404 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P10404 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P10404 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P10404 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P10404 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P10404 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P10404 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P10404 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P10404 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P10404 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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