Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ndufb1P0DN34 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Ndufb1P0DN34 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ndufb1P0DN34 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ndufb1P0DN34 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ndufb1P0DN34 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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