Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax1P09084 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax1P09084 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pax1P09084 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax1P09084 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax1P09084 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax1P09084 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax1P09084 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax1P09084 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax1P09084 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax1P09084 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax1P09084 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax1P09084 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms