Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd3P09027 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd3P09027 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd3P09027 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd3P09027 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd3P09027 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd3P09027 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd3P09027 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd3P09027 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd3P09027 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd3P09027 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd3P09027 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd3P09027 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd3P09027 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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