Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms