Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna4P07351 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms