Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa4P06798 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms