Protein–RNA interactions for Protein: P05366

Saa1, Serum amyloid A-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa1P05366 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa1P05366 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa1P05366 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa1P05366 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa1P05366 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa1P05366 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Saa1P05366 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Saa1P05366 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Saa1P05366 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa1P05366 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms