Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04212 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04212 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04212 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04212 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04212 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04212 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04212 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04212 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04212 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04212 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04212 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04212 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04212 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04212 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04212 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04212 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04212 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04212 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04212 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04212 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04212 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04212 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04212 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04212 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04212 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04212 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04212 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04212 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04212 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04212 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P04212 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P04212 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04212 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04212 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04212 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04212 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P04212 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P04212 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04212 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms