Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01664 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01664 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01664 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01664 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01664 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01664 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01664 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01664 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01664 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01664 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01664 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01664 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01664 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01664 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01664 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01664 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01664 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01664 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01664 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01664 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01664 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01664 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01664 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01664 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01664 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01664 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01664 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01664 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01664 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01664 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01664 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01664 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01664 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01664 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01664 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01664 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01664 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01664 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01664 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01664 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01664 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01664 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01664 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01664 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01664 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01664 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01664 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01664 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01664 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01664 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01664 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01664 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01664 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01664 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01664 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01664 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01664 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01664 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01664 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01664 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01664 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01664 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01664 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01664 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01664 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01664 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01664 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01664 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01664 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01664 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P01664 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01664 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P01664 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms