Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01649 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01649 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01649 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01649 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01649 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01649 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01649 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01649 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01649 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01649 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01649 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01649 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01649 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01649 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01649 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01649 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01649 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01649 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01649 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01649 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01649 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01649 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01649 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01649 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01649 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01649 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01649 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01649 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01649 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01649 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01649 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01649 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P01649 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01649 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01649 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01649 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01649 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P01649 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P01649 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01649 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01649 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01649 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01649 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01649 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01649 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01649 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01649 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01649 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01649 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01649 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01649 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01649 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01649 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01649 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01649 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01649 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01649 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01649 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01649 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01649 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01649 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01649 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01649 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01649 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01649 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01649 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01649 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01649 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01649 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01649 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01649 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01649 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01649 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01649 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01649 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01649 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01649 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01649 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01649 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01649 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01649 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01649 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01649 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01649 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01649 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01649 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01649 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01649 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01649 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01649 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01649 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01649 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01649 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01649 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01649 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01649 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01649 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01649 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01649 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms