Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01638 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01638 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01638 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01638 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01638 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01638 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01638 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01638 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01638 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01638 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01638 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01638 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01638 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01638 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01638 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01638 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01638 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P01638 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01638 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01638 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01638 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01638 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01638 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01638 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01638 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
P01638 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01638 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01638 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01638 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01638 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01638 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01638 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01638 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01638 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01638 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
P01638 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01638 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01638 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01638 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01638 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01638 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01638 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01638 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01638 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01638 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01638 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01638 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01638 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01638 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01638 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01638 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01638 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01638 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01638 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01638 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
P01638 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
P01638 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01638 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01638 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01638 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01638 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
P01638 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01638 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01638 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
P01638 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01638 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01638 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01638 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01638 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01638 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01638 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01638 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01638 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01638 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01638 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01638 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01638 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01638 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms