Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01636 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01636 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01636 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P01636 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01636 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01636 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01636 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01636 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01636 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01636 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01636 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01636 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01636 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01636 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01636 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01636 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01636 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P01636 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01636 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01636 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P01636 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01636 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01636 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01636 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01636 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01636 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01636 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01636 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01636 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01636 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01636 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01636 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01636 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01636 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01636 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01636 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01636 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01636 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01636 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01636 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01636 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01636 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01636 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01636 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01636 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01636 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01636 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01636 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01636 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01636 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01636 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01636 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01636 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01636 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01636 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01636 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01636 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01636 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01636 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01636 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01636 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01636 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01636 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01636 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01636 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01636 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01636 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01636 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01636 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01636 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01636 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01636 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01636 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01636 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01636 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01636 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01636 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01636 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01636 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01636 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01636 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01636 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01636 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01636 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01636 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01636 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01636 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01636 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01636 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01636 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01636 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01636 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01636 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01636 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01636 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01636 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01636 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01636 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01636 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms