Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PomcP01193 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PomcP01193 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PomcP01193 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PomcP01193 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PomcP01193 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PomcP01193 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PomcP01193 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PomcP01193 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PomcP01193 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PomcP01193 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PomcP01193 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PomcP01193 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PomcP01193 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PomcP01193 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PomcP01193 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PomcP01193 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PomcP01193 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PomcP01193 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PomcP01193 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PomcP01193 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PomcP01193 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PomcP01193 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PomcP01193 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PomcP01193 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PomcP01193 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PomcP01193 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PomcP01193 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PomcP01193 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PomcP01193 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PomcP01193 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PomcP01193 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PomcP01193 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PomcP01193 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PomcP01193 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PomcP01193 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PomcP01193 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PomcP01193 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PomcP01193 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PomcP01193 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms