Protein–RNA interactions for Protein: P00687

Amy1, Alpha-amylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amy1P00687 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amy1P00687 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amy1P00687 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amy1P00687 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amy1P00687 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms