Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Robo1O89026 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Robo1O89026 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Robo1O89026 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Robo1O89026 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Robo1O89026 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Robo1O89026 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Robo1O89026 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Robo1O89026 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Robo1O89026 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Robo1O89026 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Robo1O89026 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Robo1O89026 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Robo1O89026 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Robo1O89026 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Robo1O89026 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms