Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tcn2O88968 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms