Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tom1O88746 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tom1O88746 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tom1O88746 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tom1O88746 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tom1O88746 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tom1O88746 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tom1O88746 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tom1O88746 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tom1O88746 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tom1O88746 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Tom1O88746 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tom1O88746 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tom1O88746 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms