Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hcn2O88703 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hcn2O88703 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hcn2O88703 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hcn2O88703 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hcn2O88703 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hcn2O88703 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hcn2O88703 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hcn2O88703 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms