Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BlmO88700 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BlmO88700 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BlmO88700 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BlmO88700 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BlmO88700 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
BlmO88700 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BlmO88700 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BlmO88700 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BlmO88700 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BlmO88700 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BlmO88700 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
BlmO88700 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BlmO88700 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BlmO88700 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BlmO88700 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BlmO88700 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BlmO88700 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BlmO88700 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BlmO88700 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BlmO88700 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BlmO88700 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BlmO88700 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BlmO88700 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BlmO88700 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BlmO88700 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BlmO88700 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BlmO88700 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BlmO88700 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BlmO88700 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BlmO88700 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BlmO88700 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BlmO88700 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BlmO88700 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BlmO88700 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BlmO88700 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BlmO88700 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BlmO88700 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BlmO88700 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BlmO88700 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BlmO88700 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BlmO88700 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BlmO88700 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BlmO88700 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BlmO88700 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BlmO88700 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BlmO88700 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BlmO88700 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BlmO88700 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BlmO88700 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BlmO88700 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BlmO88700 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BlmO88700 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BlmO88700 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BlmO88700 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BlmO88700 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BlmO88700 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BlmO88700 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BlmO88700 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BlmO88700 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BlmO88700 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BlmO88700 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BlmO88700 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BlmO88700 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BlmO88700 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BlmO88700 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BlmO88700 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BlmO88700 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BlmO88700 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BlmO88700 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BlmO88700 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BlmO88700 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BlmO88700 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
BlmO88700 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
BlmO88700 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BlmO88700 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BlmO88700 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BlmO88700 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BlmO88700 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BlmO88700 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BlmO88700 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BlmO88700 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BlmO88700 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BlmO88700 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BlmO88700 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BlmO88700 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BlmO88700 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BlmO88700 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BlmO88700 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BlmO88700 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BlmO88700 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BlmO88700 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BlmO88700 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BlmO88700 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BlmO88700 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BlmO88700 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BlmO88700 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BlmO88700 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BlmO88700 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BlmO88700 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms