Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cops3O88543 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cops3O88543 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cops3O88543 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cops3O88543 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.3 ms