Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vti1bO88384 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms