Protein–RNA interactions for Protein: O88282

Bcl6b, B-cell CLL/lymphoma 6 member B protein, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl6bO88282 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bcl6bO88282 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bcl6bO88282 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms