Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb5O70309 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb5O70309 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb5O70309 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb5O70309 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb5O70309 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb5O70309 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb5O70309 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb5O70309 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb5O70309 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb5O70309 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb5O70309 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb5O70309 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Itgb5O70309 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itgb5O70309 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms