Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lnx1O70263 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms