Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd70O55237 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd70O55237 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd70O55237 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd70O55237 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cd70O55237 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd70O55237 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd70O55237 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd70O55237 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd70O55237 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd70O55237 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd70O55237 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd70O55237 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd70O55237 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms