Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChkbO55229 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChkbO55229 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChkbO55229 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChkbO55229 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChkbO55229 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ChkbO55229 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChkbO55229 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChkbO55229 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChkbO55229 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ChkbO55229 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChkbO55229 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ChkbO55229 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms