Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms