Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms