Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms