Protein–RNA interactions for Protein: O55098

Stk10, Serine/threonine-protein kinase 10, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk10O55098 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stk10O55098 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stk10O55098 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk10O55098 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk10O55098 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk10O55098 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk10O55098 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk10O55098 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk10O55098 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk10O55098 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk10O55098 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk10O55098 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk10O55098 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk10O55098 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stk10O55098 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk10O55098 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk10O55098 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stk10O55098 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms