Protein–RNA interactions for Protein: O55042

Snca, Alpha-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaO55042 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SncaO55042 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaO55042 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaO55042 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaO55042 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaO55042 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaO55042 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaO55042 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaO55042 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaO55042 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaO55042 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaO55042 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaO55042 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaO55042 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SncaO55042 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaO55042 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaO55042 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaO55042 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaO55042 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaO55042 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaO55042 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaO55042 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaO55042 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaO55042 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaO55042 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaO55042 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaO55042 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaO55042 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SncaO55042 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaO55042 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaO55042 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaO55042 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaO55042 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaO55042 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaO55042 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaO55042 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaO55042 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaO55042 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaO55042 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaO55042 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SncaO55042 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SncaO55042 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SncaO55042 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SncaO55042 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SncaO55042 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SncaO55042 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SncaO55042 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms