Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bnip3O55003 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bnip3O55003 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bnip3O55003 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bnip3O55003 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bnip3O55003 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bnip3O55003 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bnip3O55003 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bnip3O55003 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Bnip3O55003 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bnip3O55003 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bnip3O55003 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bnip3O55003 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bnip3O55003 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bnip3O55003 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bnip3O55003 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bnip3O55003 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms